两歧双歧杆菌和双歧杆菌的主要区别在于它们的分类、适应证和作用机理。
两歧双歧杆菌是乳制品中较为常用的益生菌之一，属于革兰氏阳性菌，而双歧杆菌则是一个更广泛的菌属，包含了多种双歧杆菌种类，且被归类为革兰氏阴性菌。这两种菌虽然都对肠道健康有益，但具体效果和作用方式有所不同。
在适应症方面，两歧双歧杆菌被视为一种双向调节的药物。它能够帮助调节肠道内菌群，从而有助于改善便秘症状。相较之下，双歧杆菌通常用于治疗由于肠道菌群失调引起的各种症状，如急慢性腹泻、便秘，以及急慢性肠炎、肠易激综合征等疾病。此外，双歧杆菌还作为肠道菌群失调所致的内毒素血症的辅助用药。
至于两者在作用机理上的差异，两歧双歧杆菌展现了对多种肠道致病菌的拮抗作用，例如福氏志贺菌、粪肠球菌、致病性大肠杆菌以及沙门氏菌等。其拮抗肠道致病菌的能力甚至比某些双歧杆菌种类还要强。而双歧杆菌主要寄居在结肠中，能降低儿童腹泻发病率，缩短轮状病毒性肠炎的病程，并有助于降低食物过敏和不耐受的情况，对治疗慢性腹泻也有一定效果。
虽然两歧双歧杆菌和双歧杆菌都对肠道健康有积极影响，但它们在分类、适应症和作用机理上存在显著差异。选择哪种益生菌应根据个人体质和具体需求来决定，并在医生的指导下使用，以确保安全有效。