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碘伏在多种情况下会变色，主要与化学反应和环境因素有关。
当碘伏与淀粉相遇，会发生显色反应，变成蓝色。这是因为碘分子进入淀粉螺旋结构空隙，形成络合物，该络合物吸收除蓝光外大部分可见光，从而呈现蓝色，常被用于检验食物中是否含淀粉。
碘伏与碱性物质混合，会改变酸碱度，影响碘稳定性，导致变色。碱性环境下，碘可能发生歧化反应，生成其他物质，颜色随之改变，同时消毒效果降低。
碘伏存放时，若长时间受阳光照射，有效成分碘分解，含量降低，颜色会逐渐变浅。从原本棕褐色，随着分解程度加深，颜色越来越淡，直至失去消毒能力。所以，保存碘伏要避开阳光直射，避免与特殊物质接触，防止变色影响使用。
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