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这两种疫苗针对的人群和病毒是不一样的，所以没有那个更好的说法。
二价的预防率已经实现84%。针对预防宫颈癌，是能够满足基本需求。除此之外，二价还有一个好处，就是可以从9岁开始接种，在早期接种和早期保护方面是最好的。
在宫颈癌的预防上，四价和二价是一样的，都是针对高危型HPV16型和18型，可以预防84%的宫颈癌。多出来的两个化合价是低风险的HPV6和11，可以预防近90%的生殖疣。这两种病毒都是低风险的人乳头瘤病毒病毒，主要能引起生殖器疣(尖锐湿疣)。也就是说，四价宫颈癌疫苗不仅可以降低患宫颈癌的风险，还可以预防男女常见的性病和皮肤病。如果只考虑防癌，二价疗效比四价疗效好。
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