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慢性肠炎可能对胎儿产生间接影响，尤其在疾病活动期风险较高。
慢性肠炎若处于稳定缓解期，通常不会直接影响胎儿发育。但持续存在的炎症反应可能导致孕妇营养吸收障碍，尤其是铁、叶酸和维生素B12等关键营养素缺乏，可能增加胎儿神经管缺陷或贫血风险。腹泻频繁的孕妇易出现电解质紊乱，影响胎盘血流灌注，长期可能限制胎儿生长。
疾病活动期的慢性肠炎患者怀孕时，体内炎症因子水平升高可能刺激子宫收缩，增加早产概率。部分治疗药物如甲氨蝶呤明确致畸需孕前停药，而氨基水杨酸类药物相对安全。建议孕前3-6个月通过肠镜评估黏膜愈合程度，调整用药方案至最低有效剂量。孕期需加强营养监测，每周测量体重增长，必要时通过肠内营养制剂补充营养缺口。
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