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辅酶通过参与关键代谢过程促进性激素、肾上腺皮质激素及褪黑激素的生成。
辅酶A在性激素合成中起核心作用，其作为乙酰基载体参与胆固醇转化为孕烯醇酮——这是所有类固醇激素的前体物质。卵巢和睾丸细胞中，辅酶A通过激活羟化酶促进睾酮、雌二醇等性激素的生物合成。肾上腺皮质细胞中，辅酶A介导的酰基转移反应加速皮质醇和醛固酮的生成，帮助机体应对应激反应。线粒体内辅酶Q10通过维持电子传递链效率，保障类固醇生成细胞能量供应。
辅酶Ⅱ（NADPH）为褪黑激素合成提供还原力，松果体细胞中其浓度变化直接影响5-羟色胺向褪黑激素的转化效率。在脂肪代谢环节，辅酶A携带的乙酰基单元通过柠檬酸循环生成ATP，为促甲状腺激素释放激素的分泌提供能量基础。维生素B12作为甲基转移酶的辅酶，参与促红细胞生成素受体信号通路的甲基化修饰，间接增强激素敏感性。
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