益生菌的副作用主要包括消化不良、过敏反应和免疫系统影响，但大多数人在正常使用下很少出现严重问题。

益生菌是一种有益的微生物，能够帮助调节肠道菌群平衡，促进消化和增强免疫力。然而，少数人在初次使用或过量使用时可能会出现一些副作用。最常见的副作用是消化不良，表现为腹胀、腹痛、腹泻或便秘。这些症状通常在几天内自行消失，但如果持续时间较长或症状严重，应停止使用并咨询医生。

过敏反应也是使用益生菌时可能遇到的问题。虽然罕见，但有些人对特定的益生菌菌株可能有过敏反应，表现为皮疹、瘙痒、呼吸困难等。如果在使用益生菌后出现这些症状，应立即停止使用，并及时就医。对于已知对乳制品过敏的人，应选择不含乳糖的益生菌产品，避免引发过敏反应。

益生菌还可能对免疫系统产生影响，特别是对于免疫系统较弱的人，如老年人、婴幼儿和患有免疫系统疾病的人。在这些人群中，益生菌可能会引起免疫系统的过度反应，导致不适。因此，这类人群在使用益生菌前应咨询医生，根据医生的建议选择合适的菌株和剂量。此外，长期大量使用益生菌可能会导致肠道菌群失衡，反而影响肠道健康。因此，建议按照推荐剂量使用，并定期评估身体反应。