1.化学结构：PQQ是一种维生素样化合物，属于辅酶类物质，具有类似维生素的结构。而SOD是一种酶，是由蛋白质组成的。
2.功能：PQQ具有抗氧化、能量代谢和线粒体保护等多种功能，可以促进细胞的健康和维持线粒体功能。而SOD则是一种重要的抗氧化酶，主要功能是清除细胞内超氧自由基，减少氧化应激对细胞的损害。
3.目标物质：PQQ主要作用于线粒体，并与线粒体相关的生理过程有关。而SOD则主要作用于细胞质和细胞核内，针对细胞内产生的超氧自由基进行清除。