作为水溶性膳食纤维的补充，菊粉并不会引起癌症。在肠道中，菊粉菌群可分解生成断链脂肪酸等一系列对人体代谢有益的产物。对于代谢病的临床治疗也有一定的作用，如便秘，改善肥胖，糖尿病等。但菊粉长期服用会改变肠道内正常菌群结构，还会诱发肝癌，所以不宜长期服用。
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