两者全是临床医学常见的中药方剂，他们的差别有：
1、特性不一样：保和丸为黑棕色的浓缩丸，气微香，味味酸、涩；木香顺气丸为深褐色的水丸，气香，味道微苦。
2、成份不一样：保和丸有山楂果、伏苓、半夏、六神曲、莱菔子、茯苓、麦芽糖、莲翘；木香顺气丸有甘松、白蔻、香附、槟郎、夏枯草、茯苓、厚朴、枳壳、赤芍、绿皮、姜片。
3、适用范围不一样：保和丸用以积食停滞不前、脘腹胀满、嗳腐吞酸、不欲饮食搭配；木香顺气丸用以湿浊中阻、脾胃不和而致的胸膈痞闷、脘腹胀痛、反胃恶心想吐、呃逆纳呆。