对已确诊的牙周病，医生会进行口腔卫生宣教，指导如何清洁牙齿、如何维护口腔卫生，然后进行系统的牙周治疗。系统性牙周治疗包括基础治疗和手术治疗，基础治疗是先进行龈上洁治，恢复1周后可进行龈下刮治，祛除引起牙槽骨吸收的牙结石和一些肉芽组织，治疗完成后1个月后复诊，复诊时如果牙周袋探针深度大于5mm，牙周有探针出血，就会考虑翻瓣术。