孕酮低的原因主要如下：

1.黄体功能不足

黄体是一种由卵巢产生的组织，它在排卵后形成并分泌孕酮。如果黄体功能不足，就会导致孕酮水平低下。黄体功能不足的原因可能是卵巢功能异常、卵巢囊肿、卵巢早衰等。此外，长期使用避孕药也可能影响黄体功能。

2.胎盘问题

在怀孕后期，胎盘会分泌孕酮来维持妊娠。如果胎盘出现问题，如胎盘早剥、胎盘前置等，就会导致孕酮水平下降。另外，胎盘功能不良也可能导致孕酮低下。

3.甲状腺问题

甲状腺是一个重要的内分泌腺，它的功能异常可能会影响孕酮水平。甲状腺功能亢进或功能减退都可能导致孕酮水平下降。且甲状腺炎、甲状腺结节等疾病也可能影响孕酮水平。

4.肾上腺问题

肾上腺是另一个重要的内分泌腺，若是肾上腺的功能异常同样也会导致孕酮水平下降。而肾上腺功能减退症是一种常见的疾病，会导致肾上腺激素分泌不足，影响孕酮水平。

5.其他因素

除了上述因素外，还有一些其他因素也可能导致孕酮水平低下。例如，长期饮酒、吸烟、过度运动、营养不良等。除此之外，一些药物，如抗抑郁药、抗生素等，也可能影响孕酮水平。