提炼深海鱼油的原料来源有以下四种：野生三文鱼，人工三文鱼，杂鱼，如柴鱼、沙丁鱼，杂鱼加豆油。深海鱼油、鱼肝油、鱼油，三者都来自鱼身，但对人的保健治疗作用各有不同，服用时不可混淆。深海鱼油是来自深海鱼类脂肪的提取物。主要成分是多元不饱和脂肪酸。可降低人体血液中的低密度脂蛋白，减少血液的黏稠度，防止血液斑块形成，具有降低血液脂肪、治疗心脑血管疾病的辅助作用。鱼肝油是从鱼的肝脏取得，属于药品。主要成分是维生素a与维生素d，用于夜盲症、眼球干燥症、佝偻病、软骨症及其他缺乏维生素a、d病症。鱼油是来源于海鱼、河鱼的鱼脂，药房有瓶装和胶丸制品出售。虽含有不饱和脂肪酸，但其降低人体血脂的作用，远逊于深海鱼油。研究证实，不论淡水鱼还是海鱼，凡人工养殖和生长期短的，其欧米伽－3脂肪酸含量都比自然生长的低。而鱼油中这种脂肪酸含量虽较少，但比他食物都高，且营养价值比深海鱼油低的多。但是，面临污染以及过度猎取，深海鱼原料容易枯竭，无法提供足够原料。