按照玛卡表皮的颜色可分为黑玛卡、紫玛卡和黄玛卡三种。其中玛卡烯、玛卡酰胺、维生素、氨基酸等核心指标的含量，黑玛卡要高于紫玛卡，紫玛卡高于黄玛卡。黑玛卡对生长环境的要求是最苛刻的，产量最少，紫玛卡次之。黑玛卡最珍贵，产量一般占总产量的3%-5%；紫玛卡占总产量的10%-15%。
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