医生不建议喝胶原蛋白肽的原因主要是因为其效果尚未得到充分科学验证，且可能存在潜在副作用和个体差异。

胶原蛋白肽作为一种流行的保健品，被广泛宣传为能够改善皮肤弹性、关节健康等。然而，目前科学研究对其实际效果的证据还不够充分。大多数研究的样本量较小，实验周期较短，难以得出长期有效的结论。此外，人体内的胶原蛋白合成受多种因素影响，如年龄、遗传、饮食习惯等，单纯依靠外源性补充胶原蛋白肽可能无法达到预期效果。

另一个原因是潜在的副作用。虽然胶原蛋白肽通常被认为是安全的，但个别人群可能会出现过敏反应，如皮疹、胃肠不适等。此外，市场上胶原蛋白肽产品质量参差不齐，部分产品可能含有重金属或其他有害物质，长期摄入存在安全隐患。因此，医生在推荐任何保健品时都会谨慎考虑其安全性和有效性。

最后，每个人的身体状况和需求不同，适合他人的不一定适合自己。对于希望通过补充胶原蛋白肽来改善皮肤或关节健康的人来说，建议在医生或营养师的指导下进行，同时注意饮食均衡、适量运动，从多方面入手，才能达到更好的健康效果。