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咳嗽主要源于呼吸道受到刺激。
要是呼吸道有异物侵入，例如吃饭时不慎呛到，致使食物残渣进入气管，人体就会启动咳嗽这一自我保护机制，借由快速呼气，利用气流的力量把异物冲出去。常见有人吃饭时不小心被食物呛进气管，身体就会本能地剧烈咳嗽，直至异物排出。
再者，呼吸道感染同样会诱发咳嗽。病毒、细菌或者支原体等病原体侵袭呼吸道后，呼吸道黏膜会发炎、肿胀。与此同时，炎症会刺激黏膜下的神经末梢，触发咳嗽反射。不仅如此，炎症还会促使呼吸道产生分泌物，像痰液，这些分泌物反过来又会刺激呼吸道，进一步引发咳嗽，以便促使痰液排出，维持呼吸道的通畅，保障呼吸的正常进行。
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