喝柠檬水的最佳时间为早晨空腹时、饭前半小时、运动后以及睡前1.5～2小时。
早晨空腹喝一杯柠檬水，可以刺激肠胃蠕动，有助于清除体内毒素，提高身体抵抗力，并清新口气。但需注意，柠檬酸可能对胃黏膜产生刺激，胃部不适者需谨慎饮用。
饭前半小时喝柠檬水，可以增加食欲，帮助消化和吸收食物中的营养物质。同时，柠檬水还具有降低食欲的作用，对于控制饮食量有一定帮助，但不建议在极度饥饿时饮用。
运动后喝柠檬水，可以补充身体所需的水分和电解质，预防脱水，同时具有缓解疲劳、提高能量水平和运动表现的功效。
睡前1.5～2小时饮用柠檬水，可以促进消化，放松身心，有助于睡眠。但柠檬水含有的酸性物质可能刺激牙齿，建议刷牙后再喝或使用吸管，且晚上过晚饮用可能会影响睡眠。柠檬水富含维生素C和膳食纤维，晚上饮用还可以起到促进消化和吸收的作用。
需要注意的是，虽然柠檬水对身体具有诸多益处，但因其含有的柠檬酸具有酸性，过量饮用可能会对牙齿和胃肠道造成刺激，因此建议适量饮用，并在饮用后及时漱口或刷牙。同时，敏感人群或有特定健康问题的人在饮用前最好咨询医生的意见。在选择柠檬水时，可以新鲜柠檬切片加入温水中，以保留其最佳的营养成分和口感。