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肠道菌群失调主要表现为消化异常、免疫紊乱及精神神经症状。
消化系统症状最为直观，腹泻与便秘交替出现是典型表现。肠道菌群失衡导致益生菌减少，影响食物分解和水分吸收，引发持续性腹泻或水样便。部分患者因肠道动力减弱、黏液分泌异常，出现羊粪状硬便或排便困难。腹胀、肠鸣和腹部隐痛常在餐后加重，与异常发酵产生的气体刺激肠壁相关。严重时粪便中可见未消化食物残渣或脓血，提示肠道黏膜损伤。
全身性症状涉及多系统功能紊乱。免疫低下表现为反复感冒、过敏反应增强，因70%免疫细胞驻留肠道，菌群失衡直接削弱防御屏障。口臭伴舌苔厚腻反映有害菌代谢产物增多，毒素经肠肝循环进入血液。焦虑、失眠、记忆衰退等神经症状与脑肠轴失调相关，肠道菌群异常影响血清素、多巴胺等神经递质合成。慢性疲劳、关节疼痛可能由菌群紊乱引发的低度炎症导致。
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