日本飞马糖在正常服用情况下副作用较小，但过量或不当使用可能引发不适反应。

从成分安全性来看，飞马糖含有的高丽参等中药材在推荐剂量内相对安全。但部分体质敏感者可能出现轻微上火症状，表现为口干舌燥、咽喉不适等。这些反应通常在减量或停用后自行缓解。建议易上火人群服用期间多饮水，必要时可配合菊花茶等清热饮品调节。

心血管系统可能受到一定影响。高丽参中的皂苷成分具有兴奋作用，可能导致血压轻微升高或心悸感。这种情况在服用后1-2小时内最为明显，对高血压患者风险更大。建议有心血管基础疾病的人群初次尝试时选择休息日，便于观察身体反应。

消化系统不良反应值得关注。空腹服用可能刺激胃黏膜，导致胃部不适或恶心。脾胃虚弱者更易出现此类症状。改进方法是改为餐后服用，并用温水送服。长期不间断使用可能干扰消化功能自主调节，建议每使用2-3周后暂停1周。

心理依赖是潜在风险之一。部分使用者因效果明显而逐渐增加服用频率，最终导致自然功能受抑制。必须严格遵循每日不超过3粒的用量建议，保持周期性停用。需要明确的是，飞马糖属于功能性食品，不能替代正规医疗，如有持续不适应及时就医。