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幽门螺杆菌感染可引发多系统疾病，以胃肠道病变为核心并影响全身健康。
幽门螺杆菌在胃部定植后，通过分泌尿素酶中和胃酸形成生存环境，其触须结构紧密黏附胃黏膜上皮细胞。这种相互作用导致胃黏膜屏障破坏，超过90%感染者发展为慢性活动性胃炎。长期感染使胃酸分泌紊乱，约15%-20%患者出现胃溃疡或十二指肠溃疡，表现为规律性上腹痛及消化道出血。持续炎症刺激可能引发胃黏膜萎缩和肠上皮化生，1%的萎缩性胃炎患者最终进展为胃癌。
该细菌的致病效应远超消化系统。其释放的毒素和炎性因子进入血液循环，可引发缺铁性贫血、特发性血小板减少性紫癜等血液疾病。口腔中定植的幽门螺杆菌是顽固性口臭和牙周病的重要诱因，根除治疗后87%患者口臭显著改善。部分感染者出现皮肤病变，如慢性荨麻疹和白癜风，机制涉及细菌毒素诱导的自身免疫反应。心血管系统受累表现为动脉粥样硬化风险增加，炎症因子加速血管内皮损伤。
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