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绝大多数肠胃炎无需手术治疗，仅极少数严重并发症需手术干预。
急性肠胃炎多由病毒或细菌感染引发，常规治疗以药物控制感染、补液维持电解质平衡为主。轻度患者通过口服补液盐、益生菌及短期禁食即可缓解，伴随呕吐腹泻时需静脉补液防止脱水。病程通常3-5天自愈，过早手术可能破坏肠道菌群平衡，加重黏膜损伤。规范化治疗下约98%患者无需手术，肠镜检查也仅在怀疑器质性病变时进行。
需手术的极端情况包括：肠穿孔引发弥漫性腹膜炎，或坏死性肠炎导致肠段缺血性坏死。这类并发症常伴随剧烈腹痛、高热及腹膜刺激征，CT检查可明确诊断。术后需进行肠道减压和抗生素冲洗，但发生率不足0.3%。医生会根据血液指标、影像学结果综合判断，及时干预可最大限度保留肠道功能，术后配合肠内营养支持恢复良好。
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