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慢性肠炎会导致营养吸收障碍、免疫力下降及肠道器质性病变。
慢性肠炎持续刺激肠道黏膜，引发绒毛萎缩和消化酶分泌减少，影响蛋白质、脂肪及维生素的吸收。患者常出现贫血、体重下降、电解质紊乱等问题，脂溶性维生素缺乏可能导致骨质疏松或夜盲症。反复腹泻加速肠道菌群失衡，致病菌代谢产物持续刺激肠壁，可能诱发溃疡、肠息肉甚至肠梗阻。
长期炎症状态会消耗免疫系统资源，增加全身感染风险。免疫因子异常释放可能引发关节疼痛、皮肤红斑等肠外症状，部分患者会发展为自身免疫性疾病。肠黏膜长期损伤可能诱发细胞异常增生，5年以上病史患者肠癌发病率较常人升高3-5倍。病程中伴随的焦虑、抑郁等心理问题会形成恶性循环，需特别关注身心综合干预。
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