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急性肠胃炎典型症状包括突发腹痛、腹泻、恶心呕吐，常伴发热和脱水。
上腹或脐周阵发性绞痛是最早出现的症状，多由胃肠平滑肌痉挛引发，触诊时腹部压痛明显但无反跳痛。腹泻每日可达10次以上，初期为未消化食物残渣，逐渐转为水样便或蛋花汤样便。约75%患者出现喷射状呕吐，胃内容物排空后会吐出黄色胆汁，严重时可导致电解质紊乱。体温通常在38℃左右波动，婴幼儿可能出现热性惊厥。
症状严重程度与感染病原体类型相关。诺如病毒感染者呕吐更为剧烈，轮状病毒腹泻持续时间更长，细菌性肠炎粪便多带黏液或血丝。持续呕吐超过12小时或6小时内腹泻超过5次需警惕脱水，表现为眼窝凹陷、皮肤弹性下降和尿量锐减。出现意识模糊、血压下降或血便时，提示可能发展为出血性肠炎或败血症，应立即就医。
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