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低聚果糖既有天然存在的，也有人工合成的。
在自然界中，低聚果糖广泛存在于多种植物中，比如菊苣、芦笋、洋葱、香蕉等。这些植物通过自身的代谢过程产生低聚果糖，作为植物体内储存能量和调节生理功能的物质。从这些植物中提取并经过适当加工得到的低聚果糖，属于天然低聚果糖。
人工合成低聚果糖则是通过特定的酶法工艺，以蔗糖等为原料，在一定条件下经过酶的作用转化而成。这种人工合成的低聚果糖在化学结构和功能上与天然低聚果糖基本一致。
无论是天然提取还是人工合成的低聚果糖，都具有益生元的特性，能促进肠道有益菌生长，改善肠道功能。在食品、保健品等领域都有广泛应用，消费者可根据产品标注和自身需求选择。
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