应用脐疗法时，一定要方法正确，否则会有副作用发生。
1.应用薰脐疗法时，应确定身体无咽喉不适或咽痛、发烧的病情发生，才可使用，以免薰后发炎现象更为恶化。
2.对于平日就容易皮肤过敏的人，宜先将产品涂抹少量于手肘内侧皮肤较敏感处30分钟后，观察其反应，如有痒、肿、红、热、痛等发炎现象时，应禁用此药。
3.薰脐前，应先用手测试一下温度，觉得太热可将艾条稍微拉一拉。
4.应用薰脐疗法时，要注意室内的适当通风，以免生成头晕、头痛等缺氧现象。
5.不宜饭后马上做或空腹施行脐疗法。