受精卵和精子在输卵管壶部受精，形成受精卵，随着其中纤毛摆动至子宫内，与子宫内膜着床，紧急避孕药通常在事后72小时内有效，有些药物会干扰受精卵着床，而宫颈粘液改变阻止精子和卵子相遇紧急避孕药并不能达到百分之百的避孕效果。
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