1、科属不同，石榴和番石榴是两者不同的水果，石榴是石榴科石榴属植物的成熟果实；而番石榴桃金娘科番石榴属植物的成熟果实。
2、性状不同，石榴味甘酸涩，性温，归胃、大肠经，没有成熟的时候果实比较酸，成熟后比较甜；而番石榴味甘涩性平，适量吃不会加重人体体寒症状。
3、外形不同，石榴和番石榴的形状以及外形也是不一样的，通常石榴形状如瘤，果型比较大，表皮多呈红色；而番石榴浆果球形、卵圆形或梨形，果型相对来说石榴要小一些，外表一般是青色的。
4、果肉不同，石榴的果肉呈现成水晶样的小籽，果皮比较薄，果实是一颗颗的；而番石榴肉质粗硬，果肉白色及黄色，胎座肥大，肉质，淡红色。
5、味道不同，石榴和番石榴是两者不一样的水果，因此口感也是不一样的，适量口感是甘甜酸涩的，成熟度越高的石榴越甜，口感清脆；而番石榴味道酸甜，并且具有一定涩味。
6、营养不同石榴中含有大量的维生素、纤维素、蛋白质等成分物质，具有一定杀虫、收敛、涩肠、止痢等功效作用；而番石榴的蛋白质、维生素c、膳食纤维素以及胡萝卜素含量较高，适量吃具有一定收敛止泻、止血等作用。