益生菌可以产酸，创造出一个不利于有害病毒和细菌存活的环境，但此处的酸（如乳酸等）主要是益生菌在食品或营养基料上发酵产生的物质，而且主要在肠道黏附后产生作用的（局部地区）。并不同于胃酸（胃酸是指胃液中的盐酸）。致病菌作用在肠道不是遍布全部肠管，而是从局部开始侵入，益生菌的抵抗作用也是在局部开始的，并不是大家理解的产生酸性物质就改变了整个肠道的弱碱性环境。