深海鱼油中的EPA和DHA还具有抗炎活性。当人体摄入的Ω-6-脂肪酸（植物油中通常大量含有）过多而Ω-3-脂肪酸不足时，机体就会产生一些化学物质导致炎性反应。深海鱼油中的EPA与DHA则可以平衡过多的Ω-6-脂肪酸，因此鱼油常被用于改善各种炎症如类风湿性关节炎等。
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