血液中脂肪(胆固醇、甘油三脂等)浓度过高是形成动脉粥样硬化的基础，而血液内运输脂肪的脂蛋白胆固醇，起着决定性的作用。脂蛋白胆固醇分为高密度脂蛋白胆固醇(HDLC)与低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)，脂蛋白的密度越低则颗粒越大。而低密度脂蛋白胆固醇容易与血管内的其他成份结合附着沉积在血管内壁，因此被称为“坏脂蛋白”。而高密度脂蛋白胆固醇(HDLC)则帮助降低血中的胆固醇，也誉称“好脂蛋白”。鱼油中的EPA则能够抑制坏脂蛋白的作用，减少在血管内壁上的附着沉积，而且能协助高密度脂蛋白胆固醇(HDL)清除血管壁上多余的脂肪，因此鱼油也被称作血管内的“清道夫”。所以服鱼油可降血脂。