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慢性肠炎主要分为感染性、非感染性和功能异常性三大类。
感染性慢性肠炎由病原体持续侵袭引发，包括细菌性（如慢性细菌性痢疾、肠结核）、病毒性、寄生虫性和真菌性感染。其中肠结核常见右下腹钝痛伴低热，粪便含未消化食物残渣；血吸虫病因虫卵沉积导致肠道纤维化，易出现腹泻与肝脾肿大。这类疾病需通过病原体检测明确类型，针对性使用抗生素或驱虫药物治疗。
非感染性类型涵盖免疫性疾病与物理损伤，包括溃疡性结肠炎、克罗恩病、缺血性肠炎及放射性肠炎。溃疡性结肠炎病变呈连续性，多发黏液脓血便；克罗恩病呈节段性分布，可能引发肠瘘。放射性肠炎常见于肿瘤放疗后，肠道黏膜萎缩导致慢性腹泻。功能异常型主要指肠易激综合征，虽无器质性病变，但存在肠道动力紊乱与内脏高敏感，临床分为腹泻型、便秘型及交替型，治疗侧重调节神经功能与饮食管理。
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