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感染性肠胃炎具有传染性。
病毒或细菌引起的急性肠胃炎可通过接触传播，例如诺如病毒通过患者呕吐物飞沫扩散，沙门氏菌通过污染食物传播。感染者发病期间及症状消失后48小时内均可能排毒，家庭成员共用餐具、卫生间时易交叉感染。2020年某学校集体食物中毒事件中，60%密切接触者因未做好隔离防护被传染。
非感染性肠胃炎如食物过敏、药物刺激或暴饮暴食则不具传染性。区分关键在症状是否伴随发热，感染性肠胃炎通常伴随38℃以上体温升高。预防传染需隔离患者餐具，使用含氯消毒剂处理呕吐物，接触后需用肥皂流水洗手20秒以上。儿童及免疫力低下者应避免接触患者直至症状完全消失72小时。
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