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肠胃炎会导致脱水、电解质紊乱、营养不良，并可能引发长期消化功能损伤。
急性肠胃炎发作时，频繁呕吐腹泻会造成体液大量流失，严重脱水可能引发低血压甚至休克。电解质像钠钾的流失会导致肌肉抽搐或乏力，儿童和老年人尤为危险。慢性肠胃炎患者因长期消化吸收障碍，可能出现贫血、体重下降、维生素缺乏等问题，免疫力随之降低。部分患者会发展成肠易激综合征，出现反复腹痛腹胀等症状。
肠胃炎引起的肠道黏膜损伤需要数周修复，期间肠道菌群失衡易引发食物不耐受。病情反复可能造成肠道屏障功能减弱，增加有害物质入血风险。恢复期应避免高脂高纤维饮食，采用米汤、蒸南瓜等易消化食物。建议分次补充口服补液盐，必要时使用蒙脱石散等黏膜保护剂。病程超过两周或出现血便、高烧需及时就医，避免发展为慢性炎症或肠道溃疡。
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