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肠炎会导致消化功能受损、营养吸收障碍。
急性肠炎直接破坏肠道黏膜屏障，引发腹泻呕吐造成水分和电解质大量流失，严重时可致脱水休克。频繁腹泻会冲刷掉肠道益生菌，导致菌群失衡，降低局部免疫力。儿童患者可能出现生长发育迟缓，老年人易因脱水诱发心肾功能异常。长期慢性肠炎持续刺激肠壁，可能引发肠溃疡、肠穿孔或癌变风险上升。
肠炎产生的炎症因子可通过血液循环影响全身。反复发作的溃疡性结肠炎患者常伴随关节疼痛、口腔溃疡等肠外表现。营养不良状态下，机体蛋白质合成受阻，伤口愈合能力下降，皮肤毛发失去光泽。部分细菌性肠炎未彻底治愈时，病原体可潜伏引发反应性关节炎或溶血性尿毒综合征。孕妇患严重肠炎可能因营养缺乏影响胎儿发育，需特别警惕。
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