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PQQ在推荐剂量内可长期服用。
现有研究表明，每日摄入20毫克以内的PQQ持续6-12个月未见显著不良反应。动物实验中，大鼠连续90天摄入100毫克/千克体重剂量仍保持正常肝肾功能。人体耐受性试验显示，健康受试者连续4周每日服用60毫克仅出现轻微头痛或胃肠不适，停药后症状消失。长期服用需关注线粒体功能指标，避免过度刺激细胞代谢。
特殊人群需谨慎制定服用周期。孕妇或哺乳期女性缺乏安全数据支持，建议暂停使用。自身免疫性疾病患者长期服用可能增强免疫应答，需监测相关抗体水平。建议每3个月停用2-4周观察身体反馈，同时避免与高剂量抗氧化剂（如维生素C）联用，防止干扰PQQ的氧化还原信号通路。
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