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肠胃炎通常会引起腹痛，且疼痛程度与炎症严重性相关。
肠道黏膜受细菌、病毒或毒素刺激时，会触发神经信号引发痉挛性疼痛，多集中于脐周或下腹部。急性肠胃炎疼痛呈阵发性绞痛，伴随肠鸣音亢进，排便后可能暂时缓解。慢性肠胃炎多为隐痛或灼痛，餐后加重，因长期炎症导致肠道敏感性增高。部分患者还会出现胃脘部胀痛，尤其胃炎合并肠炎时，疼痛范围可能扩散至上腹部。
疼痛程度受病原体类型影响，诺如病毒感染者疼痛较轻，志贺菌感染则可能引发剧烈腹痛。儿童因肠壁较薄更易出现明显绞痛，老年人因痛觉迟钝可能表现为腹部不适而非典型疼痛。治疗时除使用解痉药如匹维溴铵外，需针对病原体选择抗生素或抗病毒药物。持续剧烈腹痛伴便血、发热时，需警惕肠穿孔或中毒性巨结肠等并发症，应立即就医。
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