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吡咯喹啉醌（PQQ）主要通过微生物发酵法和化学合成法提取制备。
微生物发酵是当前工业化生产PQQ的核心工艺。该方法选用特定菌株如甲基杆菌属、醋酸杆菌属或基因改造后的生丝微菌作为生产菌，通过优化碳源（甲醇、甘油）和氮源配比，在发酵罐中进行高密度培养。菌株在代谢过程中将前体物质转化为PQQ，随后采用离心分离、超滤浓缩和层析纯化技术，从发酵液中提取出高纯度产物。
化学合成法则通过多步有机反应构建PQQ的三环醌式结构。以邻苯二酚或吡咯衍生物为起始原料，经过环化、氧化、羧基化等反应组装分子骨架，再通过结晶纯化获得终产品。该方法能快速获得高纯度产物，但对设备要求严苛且产生较多副产物，多用于实验室级PQQ制备。
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