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pqq线粒体和辅酶q10都是非常重要的物质，但是它们之间也存在着一些区别。
pqq线粒体是一种细胞内的辅酶，它主要存在于线粒体中，主要作用是在细胞呼吸过程中，促进氧化还原反应的进行。同时，pqq线粒体也可以促进细胞的生长和分裂，维持细胞的正常代谢活动。而辅酶q10主要存在于细胞质膜和线粒体内膜上，的主要作用是在细胞呼吸过程中，促进氧化还原反应的进行。同时，辅酶q10还具有抗氧化，保护细胞免受氧化损伤的作用。
此外，pqq线粒体和辅酶q10的结构也有所不同。pqq线粒体是一种具有类似维生素的结构，它由两个吡啶酮环和一个辅基组成。而辅酶q10则是一种具有长链脂肪酸结构的物质，它由一个呋喃环和一个长链脂肪酸组成。
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