由于肠道病毒感染，手足口病多发生于5岁以下婴幼儿，其潜伏期大约为2~7天，传染源包括患者和隐性感染者。患儿是手足口病流行期间的主要传染源，在发病急性期，患儿可自咽排毒，唾液中含有病毒；此外，人类是手足口病的唯一宿主，引起该病的肠道病毒有20多种，因此手足口病患儿的粪便也是感染的病原体之一；患儿手足口病后，手足口、口腔等部位都会出现明显的疱疹，疱疹破溃后流出的疱疹液也是感染的主要病原体。