鲜黄花菜中含有的毒素主要是秋水仙碱。秋水仙碱本身是无毒的，但进入人体后被氧化成氧化二秋水仙碱，则含有剧毒，会对肠胃及呼吸系统产生强烈的刺激。秋水仙碱在中枢神经系统中表现出剧烈的毒性作用。它可以通过阻断神经递质乙酰胆碱的释放和抑制乙酰胆碱酯酶的活性，导致神经递质的累积。这会干扰神经细胞之间的正常通信，并引发一系列中枢神经系统的症状，包括抽搐、震颤、兴奋或抑制行为、意识丧失等。