(1)孕妇，婴儿。大豆异黄酮在年幼女性体内也表现出雌激素活性，因此可以促进幼女性早熟。而且，大豆异黄酮可以通过胎盘进入胎儿体内，通过乳汁进入婴儿体内，因此，如果孕妇或者乳母补充大量大豆异黄酮，这些物质可以间接进入胎儿或婴儿体内，其雌激素样作用可能会促进女性胎儿或者女婴的异常发育(如乳腺和子宫内膜异常增生)。虽然这些不良作用尚未在人类中证实，但是国内外许多研究者都已经利用大鼠实验证实了这种不良作用。因此，孕妇、哺乳期妇女以及年幼女性在正常膳食情况下不要补充大豆异黄酮。(2)患有乳腺增生，小叶增生，乳腺癌，子宫肌瘤等疾病的不能服用大豆异黄酮?有肿瘤史者，特别是恶性肿瘤，如乳腺纤维囊肿疾病、乳腺癌、子宫肿瘤(包括子宫肌瘤者)及生殖器癌瘤等应禁用。血栓性疾病如脑血栓、脑血管痉挛、血栓性静脉炎、肺栓塞或有此类疾病史者应禁用。胆囊炎患者应禁用，因雌激素能使胆汁淤积，使病情加重。阴道出血诊断未明确者禁用。急性肝脏疾患，或慢性肝功能损伤禁用。当肝脏有损害时，肝脏对雌激素的结合、灭活等发生障碍，雌激素蓄积会促使子宫内膜增殖或发生子宫内膜癌。充血性心力衰竭、肝肾疾病所致的水潴留者禁用。雌激素能刺激肝脏使血管紧张素原增加，便于血管紧张素的合成，后者能刺激肾上腺分泌醛固酮，导致水钠潴留。