异黄酮在自然界中的分布只局限于豆科的蝶形花亚科等极少数植物中，如大豆、墨西哥小白豆、苜蓿和绿豆等植物中，其中异黄酮含量最高的只有苜蓿和大豆，一般苜蓿中异黄酮的含量为0.5%－
3.5%，大豆中异黄酮含量为0.1%－0.5%。品种和栽培环境对大豆中的异黄酮含量和种类分布都有很大的影响。不同品种中的异黄酮含量和种类分布有很大的差别，异黄酮总含量变幅为0.1%－0.5%。日本和美国大豆品种的异黄酮含量分别为
1.2%－
2.3%和
2.1%－
4.2%，异黄酮总量表现为美国品种大于日本品种。我国大豆品种异黄酮含量一般为
1.2%－
2.5%，其中尤以东北大豆中的异黄酮含量为高，一般在
1.8%－
2.3%。