线粒体的副作用和危害主要包括细胞内能量代谢障碍、氧化应激、DNA损伤和细胞凋亡等。

线粒体是细胞内的能量生产中心，参与ATP的合成。当线粒体功能受损时，会导致细胞内能量代谢障碍，影响细胞正常功能。例如，线粒体功能异常会导致肌肉无力、疲劳、代谢性疾病等症状。

线粒体在细胞内也承担着氧化还原反应，但这也使得线粒体成为氧化应激的主要场所。氧化应激会导致线粒体内产生大量的自由基，进而损伤线粒体膜和DNA，加速细胞衰老和死亡。

线粒体的DNA相对核DNA更容易受到损伤，而线粒体DNA的修复能力有限。线粒体DNA的损伤会导致线粒体功能异常，进而影响细胞的正常代谢和功能。

综上所述，线粒体的副作用和危害主要表现在影响细胞内能量代谢、氧化应激、DNA损伤和细胞凋亡等方面。因此，保护线粒体功能对维持细胞健康和延缓衰老至关重要。