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基孔肯雅热病毒是一种单股正链RNA病毒，主要特征包括结构简单、依赖伊蚊传播、易引发慢性关节症状。
病毒外层包裹脂质包膜，表面糖蛋白可与人体细胞受体结合，通过内吞作用进入细胞。其基因组编码结构蛋白和非结构蛋白，复制过程在细胞质中完成。传播途径完全依赖埃及伊蚊和白纹伊蚊叮咬，病毒在蚊体内需经历2-10天的复制周期才能具备传染性。感染者急性期血液中病毒载量可达10⁶copies/mL，但病毒在环境中存活能力较弱，对高温和干燥敏感。
病毒变异主要发生在不同宿主间传播时，可能影响致病性或传播效率。感染后典型表现为双峰热、剧烈小关节疼痛及皮疹，约50%患者关节痛可持续3个月以上。目前尚无特效抗病毒药物，治疗以对症支持为主。疫苗研发虽取得进展（如Ixchig和Vimkunya），但尚未广泛接种。病毒在免疫功能低下者中可能导致长期并发症，如滑膜增厚、骨髓水肿等慢性病变。
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