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夏枯草以果穗入药为主。
《中国药典》明确规定夏枯草正品为唇形科植物夏枯草的干燥果穗，采收期为夏季果穗呈棕红色时。果穗含迷迭香酸、熊果酸等核心活性物质，其中迷迭香酸含量高达3.2%，是茎叶的5-8倍。传统炮制要求除去杂质后晒干，现代研究证实果穗水煎液的降压效果比全草提取物强40%，对甲状腺结节缩小的有效率提升27%。
部分地区习用全草入药，茎叶中黄酮类物质含量较高但药效组分比例失衡。全草制剂更易引发胃肠刺激，因纤维质含量达果穗的3倍。治疗目赤肿痛时应专用果穗，而调理淋巴肿大可配伍20%干燥全草。脾胃虚寒者服用全草制剂后腹泻发生率高达35%，果穗制剂仅8%。购买时需观察药材形态，正品果穗呈棒状带宿萼，伪品常混入过多茎秆。
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