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肠道菌群失调可以通过医学检查准确诊断。
临床常用粪便涂片镜检和细菌培养进行初步判断，直接观察菌群比例及异常菌种增生情况。乳果糖耐受性试验可评估小肠消化功能，通过检测血液代谢产物判断菌群代谢异常。呼气测试（如氢呼气试验）能快速筛查小肠细菌过度生长，患者服用特定底物后分析呼出气体成分变化。
基因测序技术（如16SrRNA测序）可精准分析肠道微生物种类和丰度，检测率比传统方法提升40%以上。部分医疗机构提供粪便菌群悬液检测，通过高通量测序解析500+菌种信息。检查前需禁食高纤维食物24小时，避免服用益生菌或抗生素3天，确保样本反映真实菌群状态。
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