治疗男性生殖器疱疹以药物为主,治疗以抗病毒药为主,如伐昔洛韦、阿昔洛韦等,治疗时间为7~10天,外用药可用莫匹罗星软膏或红霉素软膏。病人在治疗期间要注意多休息,不能过度劳累,饮食要清淡,不能吃辣椒、烈性酒等刺激性食物,治疗后要定期复诊。