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肠炎典型症状包括腹痛、腹泻、恶心呕吐及发热。
腹痛多集中于脐周或下腹部，呈阵发性绞痛或持续性钝痛，排便后可能暂时缓解。腹泻每日可达10次以上，粪便呈水样或黏液状，细菌性肠炎可能伴有血便或脓液。呕吐常与进食相关，严重时可导致脱水，出现口干、尿量减少。体温升高多见于感染性肠炎，可达38-39℃，伴随寒战或全身乏力。
部分患者出现里急后重感，即频繁便意但排便量少。慢性肠炎可能伴随体重下降、贫血等营养不良体征。儿童患者易发生惊厥或意识模糊等神经系统症状。过敏性肠炎常见皮肤荨麻疹或关节疼痛。重度病例可见眼窝凹陷、皮肤弹性降低等脱水征象，电解质紊乱会引发肌肉痉挛或心律失常。
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